La métagénomique pour surveiller les microbes

Des chercheurs de Singapour publient dans la revue Nature microbiology un article sur la métagonomique. La métagénomique consiste à analyser le matériel génétique présent dans un échantillon, pouvant appartenir à des microorganismes pathogènes ou non, vivants ou morts, indépendamment d’une mise en culture. Cette technologie présente de nombreux avantages pour la surveillance des agents pathogènes d’origine alimentaire, comme l’identification simultanée de micro-organismes, éventuellement non cultivables. De la préparation des échantillons à l’analyse bio-informatique, les défis à relever et les perspectives sont discutés dans cette revue.

En savoir plus : bulletin de veille du 16 juin de la Plateforme de surveillance de la chaîne alimentaire

Référence : Ko KK, Chng KR Nagarajan N. Metagenomics-enabled microbial surveillance. Nat Microbiol 7, 486–496 (2022).

Auteur : Nature Microbiology