Microbiote des ruminants et méthane entérique : un levier écologique pour l’atténuation des émissions (TRADUCTION)

Le rumen, véritable écosystème microbien, joue un rôle clé dans la digestion des ruminants, mais il est aussi à l’origine de la production de méthane entérique (CH₄), un gaz à effet de serre préoccupant. Cette revue explore les mécanismes écologiques et évolutifs qui façonnent le microbiote des ruminants et son influence sur la production de CH₄. Les chercheurs proposent ici un cadre innovant pour comprendre et réduire les émissions en ciblant les interactions hôte-microbe, ouvrant ainsi la voie à des stratégies d’atténuation durables.

Les ruminants fournissent de la viande, du lait, de la laine et d’autres produits nécessaires à la subsistance de l’Homme. Dans le tube digestif des ruminants, le rumen abrite un écosystème microbien complexe et diversifié. Ces microbes génèrent une grande partie des nutriments dont l’animal hôte a besoin. Cependant, le méthane entérique (CH₄) est également produit au cours de la dernière étape de la digestion anaérobie. L’inquiétude croissante du public face au changement climatique mondial a poussé le secteur agricole à intensifier ses recherches sur l’atténuation du CH₄. De nombreuses méthodes d’atténuation du CH₄ ont été explorées, avec des résultats variables. Avec l’avènement des nouvelles technologies de séquençage, les interactions hôte-microbe qui interviennent dans les processus de fermentation ont été examinées afin d’améliorer les stratégies d’atténuation du CH₄ chez les ruminants entériques.

Dans cette revue, les chercheurs décrivent les connaissances actuelles sur les facteurs qui déterminent l’assemblage microbien des ruminants, leur lien avec la fonctionnalité et la manière dont les approches d’atténuation du CH₄ influencent les gradients écologiques et évolutifs. D’après les données analysées, de nombreuses propriétés écologiques et évolutives agissent en effet en tandem dans la constitution du microbiote des ruminants et sa propension à produire du CH₄. En outre, cette revue de la littérature fournit un cadre conceptuel pour les recherches futures, dans lequel les dynamiques écologiques et évolutives expliquent l’atténuation du CH₄ dans la composition microbienne des ruminants.

Référence :       Frazier AN, Beck MR, Waldrip H, Koziel JA. Connecting the ruminant microbiome to climate change: insights from current ecological and evolutionary concepts. Front Microbiol. 2024 Dec 2; 15:1503315 (PDF disponible en libre accès)

Source : Frontiers in Microbiology