Consortium Pangenome Bovin : sa mission, décrire toute la diversité génomique de l’espèce

La construction d’une séquence génomique de référence unique par espèce a beaucoup apporté à l’analyse génomique et à la compréhension du fonctionnement du génome. Elle donne cependant une représentation incomplète de la diversité des génomes au sein d’une espèce. Les nouvelles technologies de séquençage permettent la production de fragments de séquence plus longs, offrant une meilleure connaissance des génomes de chaque espèce. Afin de tirer tous les bénéfices de ces avancées, une collaboration internationale d’envergure, le « Consortium Pangénome Bovin », a été créé. Sa mission : produire un pangénome, c’est-à-dire un large ensemble de génomes assemblés de haute qualité et connectés entre eux, permettant de décrire toute la diversité génomique de l’espèce. Un article publié dans Genome Biology en juin 2023 livre les détails de ses objectifs.

Pour en savoir plus : Création du Consortium Pangenome Bovin

Référence : Smith T.P.L., Bickhart D.M., Boichard D., Chamberlain A.J., Djikeng A., Jiang Y., Low W.Y., Pausch H., Demyda-Peyrás S., Prendergast J., Schnabel R.D., The Bovine Pangenome Consortium, Rosen B.D. 2023. The Bovine Pangenome Consortium: democratizing production and accessibility of genome assemblies for global cattle breeds and other bovine species. Genome Biology, 24, 139. (PDF en libre accès)

Source : INRAE